КП ХОР «ФАРМАЦІЯ» створено рішенням Харківської обласної ради від 08 вересня 2016 року № 284-VII «Про створення КОМУНАЛЬНОГО ПІДПРИЄМСТВА ХАРКІВСЬКОЇ ОБЛАСНОЇ РАДИ «ФАРМАЦІЯ», припинення деяких комунальних підприємств шляхом х злиття у КОМУНАЛЬНЕ ПІДПРИЄМСТВО ХАРКІВСЬКОЇ ОБЛАСНОЇ РАДИ «ФАРМАЦІЯ» та внесення змін до додатку до рішення обласної ради від 20 червня 2013 року № 780-VI».